高密度脂蛋白胆固醇可保护血管内膜，防止发生动脉粥样硬化，故被称为“好胆固醇”。高密度脂蛋白胆固醇降低见于高甘油三脂血症、脑血管病、冠心病、糖尿病、肝功能损害、吸烟、缺乏运动等。
低密度脂蛋白胆固醇增高会损伤动脉血管内皮，而且进入到动脉内膜的低密度脂蛋白胆固醇，可刺激动脉平滑肌细胞增生，导致动脉粥样硬化形成，从而加速高质血症、急性心肌梗塞、冠心病、肾病综合症、慢性肾功能衰竭、肝病、糖尿病、骨肿瘤等疾病的发生。
医学研究证实，降低低密度脂蛋白胆固醇水平能显著降低心脑血管疾病的发病率。
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